如何利用ntsys计算遗传距离

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1．将已赋值好的Excel文件放于桌面，假设命名为A.xls，保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式，即A1=1，表示出现等位基因；B1=132，表示等位基因数，C1=189表示品种数；D1=0表示不出现等位基因。从A3开始，在第一列标上所有的SSR引物，从B2开始，第二行标上所有的品种名，由此得到一个数据矩阵。

2．双击NTSYS软件，选择file→edit file，选择A.xls文件，将出现NTedit1.2编辑器，点击file→sale file as选项，将导入的Excel文件转换为软件识别的格式，命名为A-1.NTS文件。

3．点击Ntsyspc2.1界面的“Similarity”，点击“Genetic distance”；在Input data file中输入A-1.NTS；在Output file中输入A-2.NTS，点击Compute；则计算好的遗传距离放在A-2.NTS文件中。

4．点击Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file，选择A-2.NTS，即可查看到品种间的遗传距离。

1小时前