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孔雀鱼的繁殖方式如下，雄性孔雀鱼的臀鳍进化为授精器，通过授精器和雌鱼进行交配，受精卵在雌鱼的腹内进行孵化，卵化时间满足后以仔鱼的形式生出。这种繁殖方式被称为"卵胎生"。
胎生和卵生的最大不同在于，胎生的动物是通过脐带从母亲那直接获得养分，但是卵胎生的幼体则是在母亲体内，通过吸收自已卵黄部分的养分发育的。而称为卵胎生的方式，表面上看起来类似胎生，但实际上是在母亲体内由卵孵化而来。
孔雀鱼在出生4-6个月之后就进入繁殖的适龄期。其实开始繁踵的时间还可以提前一些，所以从出生后就需要把雌性和雄性分开饲养。否则，仔鱼在出生两个月后就有可能会生出自己的下一代。通常产仔时间大约在将雌鱼和雄鱼(之前没有交尾经验)放在一起饲养的一个月之后，但是一些变种或自子个体则需要更长一段时间。另外，一次交尾后，雌鱼会有两次或三次产仔，而自子个体多会在第二次产仔时由无精卵发育而来。
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