pdb是什么单位

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PDB是protein data bank的简写,在生物学软件中,一般把蛋白质的三维结构信息用pdb文件保存。

PDB文件本质是一种ASCII码文件,可以用普通的文本编辑器编辑,也可以用专业软件编辑。不过要展示该文件所表示的蛋白质三维空间结构则需要借助相关软件,如winCoot、Moe等。

PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍. 对大多数用户而言, 了解这些内容就够了, 但对那些需要创建PDB文件的用户, 请参考PDB格式官方文档.

完整的PDB文件提供了非常多的信息, 包括作者, 参考文献以及结构说明, 如二硫键, 螺旋, 片层, 活性位点. 在使用PDB文件时请记住, 一些建模软件可能不支持那些错误的输入格式.

PDB格式以文本格式给出信息, 每一行信息称为一个 记录(record). 一个PDB文件通常包括很多不同类型的记录, 它们以特定的顺序排列, 用以描述结构.

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