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能生长黑木耳的树种很多，已发现长有野生木耳的树种有：壳斗科、杨柳科、桦木科、榆科、桑科、胡桃科、槭树科、豆科、悬铃木科、樗树料、漆树科、柿树科等树种。华中农业大学校园里的樟树上，经整枝的截面上和已裂口的树杆上也长有许多黑木耳，伐到的樟树上也可采到黑木耳。
究竟用哪些树种来生产黑木耳，各地可根据当地的情况，选择资源较多、易栽培、生长速度快、再生能力强而营养丰富的树种，以利于黑木耳生产的发展和获得高产。
华中地区多采用栓皮栎和麻栎来生产黑木耳。这类树种资源多，易造林，萌蘖更新能力强。同时，它的栓皮层还具抗晒、保温、保湿的功能，木材的髓射线较宽，导管粗，有利于菌丝生长蔓延，且其边材发达，营养丰富，木质硬耐腐，
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