prime5怎么设计cdna全长引物

风信逐 1个月前 已收到1个回答 举报

摸摸我刘海 1星

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打开软件,点击File-New-DNA sequence

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弹出一个新窗口,将核苷酸序列复制到窗口中,之后点击primer

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再次弹出新的窗口,此时页面上会给出一对引物信息,不过一般这对引物质量不好,根据你设计需要,选择Search,修改引物设计参数

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确定后,会得到一个search results,里面给出了搜索到的搜有引物的信息,点击每个引物,在primer premier窗口中会显示这个引物的具体信息,除引物设计一般需要注意的点以外,还需要注意是否有二级结构和错配

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选好上下游引物后,点击primer premier中的edit primers,可以得到可复制的引物序列。这样引物就设计好了,如果有参考基因组的话,最好在参考基因组中blast一下设计的引物,看是否是单拷贝,这一点很重要

7小时前

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