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Illumina测序原理主要包括以下几个步骤:
文库片段附着到“flowcell上的oligo”:DNA文库两头的序列和芯片上的引物碱基互补,因此可以通过氢键力互补杂交。 待测序的DNA片段通过氢键力与第一种oligo配对从而固定在flowcell上。
被文库片段附着的oligo延伸出互补的DNA链:加入DNA聚合酶和dNTP,flowcell上的oligo做引物,以文库片段为模版,合成出一条全新的DNA链(和原来的文库片段序列完全互补)。
冲走文库片段:加入NaOH碱溶液,破坏氢键力,模版链(文库片段)被冲走,只剩下与芯片通过共价键连接的DNA链。
扩增:使用高通量测序仪对DNA链进行扩增,得到测序结果。
以上是测序的基本原理,具体操作还会受到测序仪的型号、测序的序列、测序的数据分析方法等多种因素的影响。
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